MRI scans kunnen afwijkingen in de hersenen aantonen, zoals atrofilie; het “verschrompelen” van de hersenen door het afsterven van cellen.  Ook het testen van het hersenvocht kan de diagnose vaststellen: Bij Alzheimer patiënten zijn eiwitten afkomstig van de plaques aantoonbaar aanwezig in het hersenvocht. Als de ziekte vaker in een familie voorkomt, of als de eerste kenmerken op jonge leeftijd ontstaan kan er met behulp van genetisch onderzoek onderzocht worden of het om een erfelijke vorm van de ziekte gaat. (1)

In de linker afbeelding is het eiwit APP aangekleurd, waarbij opvalt dat er bij een gezond persoon wel wat APP aanwezig is maar niet zoveel als bij een persoon met Alzheimer. Ook is duidelijk te zien dat na verloop van tijd de APP concentratie toeneemt in de hersenen.                                   In de rechter afbeelding is weergegeven hoe de hersenen verschrompelen (atrofilie) ten opzichte van gezonde hersenen. (1)